这种神秘体验的就是那些细而长，嵌满彩色玻璃，幽暗而神秘的哥特式彩色玻璃花窗——哥特式建筑的显著装饰特色之一。而米兰大教堂的玻璃窗可能是全世界最大的，高约20米，共有24扇，主要以耶稣故事作为主题，正中的太阳光彩图案寓意正义和仁爱，这些彩色玻璃没有在长达500多年前的风风雨雨中损毁，至今仍光彩夺目
教堂的另外一个重点是彩色玻璃，在教堂内的彩色玻璃都非常特别，用玻璃制作图像台凸显出圣经里的人物或是故事，如为基督教徒会被这里的彩色玻璃所吸引，在教堂内部总共有56个玻璃窗，31个圆形的玫瑰图案以及25个彩色幅彩色玻璃窗的精美图案，但是在这56个玻璃窗只有4个是最完整无瑕的，其它的玻璃窗都是在1949-1951由当地主教的居民进行一些整修，而这些彩色玻璃窗都是由法国沙特尔省的LorinFirm所制造。
现如今，彩色玻璃已不是教堂的专属，它走近了大众，许多富户选择它来装点自己的家，这是很明智的选择。这些幻境般的彩色玻璃也叫炫彩玻璃，当日光照射玻璃时，形成五彩斑斓、灿烂夺目的幻境效果。而当夜幕隆临，从建筑内部放射出的彩色光芒，更是景象万千，让人不禁驻足欣赏。现在，炫彩玻璃不仅出现在教堂，也在许多建筑和大型会所、别墅中得以应用，形成别致的一道风景线,?让人叹为观止!
彩色玻璃窗的使用在12世纪中叶得到了普及，圣丹尼斯的修道院院长苏格被称为“彩色玻璃之父”，因为是他首次概念化地使用彩色玻璃窗来创造一种“天堂之光”，被视为上帝在教堂中的存在